El MAM posee una colección de obras que han sido donadas desde su origen por los artistas, quienes han depositado su confianza en el Museo. La Colección Permanente del MAM está mayoritariamente conformada por obras de artistas vivos, por lo que cada vez que ellos exponen en las muestras, se presenta la oportunidad de renovar o actualizar la presencia de cada artista en ella.
* Para revisar los detalles de la Política de Colección del MAM Chiloé (adquisición, préstamo, registro, difusión y otros), puedes revisarla en este documento.
El área de Conservación del Museo de Arte Moderno Chiloé, que cuenta con un laboratorio y taller de restauración, ofrece a particulares, centros culturales y museos de la región, servicios de diagnóstico del estado de conservación de obras de arte, análisis, conservación preventiva y embalaje.
COLECCIÓN EN RUTA. Una vez al año el MAM Chiloé presenta parte de su colección permanente en alguna otra localidad de Chile. Este año se presenta en Puerto Varas desde el 16 de enero hasta el 16 de marzo, en el Centro de Arte Molino Machmar.
La Colección Permanente del MAM Chiloé se ha conformado desde 1988 y contiene mas de 600 obras únicas del arte contemporáneo nacional y poco a poco, a través de su ordenamiento, catastro y conservación se ha transformado en un referente nacional de importancia para una época del arte determinada, especialmente la década de los 80 y 90. Gracias a fondos concursables de Gobierno de Chile, la Colección se ha registrado, ha sido publicada y han comenzado las tareas para su adecuada conservación. Para revisar el listado actualizado (2020) de las obras que conforman la Colección Permanente del MAM mira abajo ↓↓↓
El año 2018 el MAM Chiloé recibió 
